Đồng thời, Bộ Tài nguyên và Môi trường phối hợp với các Bộ trên hoàn thành Quy trình vận hành liên hồ chứa trong các tháng mùa kiệt, trình Thủ tướng Chính phủ xem xét, ban hành trong quý I/2013.
Theo Quyết định 1879/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ, 61 hồ thủy lợi, thủy điện trên lưu vực 11 sông phải xây dựng quy trình vận hành liên hồ chứa.
Trong đó, riêng lưu vực sông Đồng Nai có 13 hồ phải xây dựng quy trình vận hành liên hồ chứa gồm các hồ: Dầu Tiếng, Trị An, Thác Mơ, Đơn Dương, Đa Mi, Hàm Thuận, Cần Đơn, Đại Ninh, Đồng Nai 2, Đồng Nai 3, Đồng Nai 4, Srok Phu Miêng và Phước Hòa.